Selber Spielen oder Auto Play?

Selber Spielen:

Wenn du selbst spielst, dann hast du die volle Kontrolle darüber wie die Überlebenden dein Dorf verteidigen. Das kann durchaus in Stress ausarten, aber du kannst so am besten auf die unterschiedlichen Zombies reagieren.
Ein Scharfschütze, ist zum Beispiel nicht dazu geeignet eine Horde von kleinen Zombies auszuschalten. Er kann viel besser mit einzelnen und großen Gegnern fertig werden. 
Jeder Zombie hat außerdem spezielle Schwächen und jede Waffe spezielle Stärken. Die Schwächen und Stärken kannst du am besten ausnutzen wenn du selbst spielst.

Auto Play:

Lehn dich zurück und schau deinen Überlebenden zu wie sie dein Dorf verteidigen. Dies ist vor allem in den früheren Nächten sehr effektiv und relativ sicher. Allerdings wirst du feststellen, dass das Spiel manchmal die "falschen" Überlebenden einsetzt. So versucht zum Beispiel ein Scharfschütze gegen eine Horde von kleinen Gegnern anzukommen. Dabei ist ein Scharfschütze viel besser darin große und starke Gegner auszuschalten. 
Deine Überlebenden setzen auch nicht ihre speziellen Fähigkeiten ein wenn du auf Auto Play schaltest. Aber du kannst sie trotz Auto Play selbst noch aktivieren. Auto Play zieht auch nicht die Schwächen und Stärken von Zombies und Waffen in Betracht.
Auto Play ist also mehr ein halbautomatischer Modus. Du kannst auch deine Ausrüstung, z.B. Granaten, in diesem Modus nutzen.

Welcher Modus ist besser?

Das entscheidest du am besten für dich selbst. Probiere beide Modi und nutze den der dir besser gefällt. Beide haben ihre Vor- und Nachteile. Du kannst auch jederzeit zwischen beiden Modi hin und her schalten. So kannst du die Kontrolle wieder übernehmen, sollten deine Überlebenden automatisch nicht optimal verteidigen.